医疗保险费用的支付方式从付费的时间上看，可分为后付制和预付制两种

后付制是指在提供了医疗服务之后,医疗保险机构根据医疗费用开支的多少,向医疗机构或病人支付医疗费用。预付制是指在医疗服务机构提供医疗服务之前,医疗保险机构就按合同向医疗服务机构提前支付费用。
从费用支付所发生的关系上看,可分为由医疗保险机构同医疗服务机构直接结算以及参保人就诊时,先由患者垫付,然后患者再凭就医的诊断和费用凭证同医疗保险机构进行结算两种。
从医疗保险费用的具体支付方式上看,可分为按服务项目支付、按人头支付、按平均费用支付、按病种分类支付、总额预算制、工资制、以资源为基础的相对价值标准制。
1.按服务项目支付。是指医疗保险机构根据定点医院所提供的医疗服务的项目和服务量,对它们作出费用补偿的办法。它属于费用后付制办法。具体地说,它是由医疗保险机构根据医院报送的记录病人接受服务的项目（如诊断、治疗、化验、药品、手术、麻醉、护理等）和收费标准的账单,向医疗单位直接付费,或先由病人垫付,病人再从保险机构得到部分或全部补偿。
按服务项目支付是医疗保险中最传统,也是应用最广泛的一种费用支付方式。中国长期以来实行的劳保医疗和公费医疗制度就是采用按项目支付费用的办法,也叫实报实销。这种付费方式的优点是实际操作简便,适用范围较广。其缺点是由于医院收入同提供医疗服务的多少有关,因而具有诱导医疗服务机构提供过度医疗服务的倾向。医院通过增加服务项目和服务量,延长住院时间,争先购置先进诊治设备,开贵重的进口药品等方法获取更多的费用偿付,造成卫生资源的浪费。同时,由于医疗费用由第三方保险机构事后支付,使医院与病人都不关心费用问题,甚至可能出现合伙欺骗保险公司,报假账,获取更多的医疗保险资金的问题。作为第三方的保险机构处于被动的地位,它只能在事后对账单进行审查,难以有效地控制医疗费用的浪费。如果保险机构想控制医院避免提供过度服务,必然要投人大量的人力、物力,高度介入医疗行为的规范和审查,这样,必将大大增加医疗保险机构的管理成本。按服务项目支付医疗费用的办法是引起医疗费用上涨的主要原因之一。据国外研究估计,卫生医疗费用上涨的12％左右是由于医疗保险机构按服务项目补偿造成的。

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